とりあえず IPv6 はつながったので masy さめにいろいろと教えてもらいつつ、アプリの設定などをしてみる。といっても、素晴らしいことにパッケージが合ったりするので、
deb http://www.debian.or.jp/~kitame/ipv6/ ipv6 unstable deb http://masy.families.jp/debian/ ./
して、apt-get update; apt-get upgrade して、/etc/ssh/sshd_config に Listen :: を追加しただけである。これで apache と ssh が IPv6 enable になった。